Программа базируется на положениях представленной выше концепции реабилитации наркологических больных, и предложенных НИИ наркологии «Стандартах (моделях протоколов) реабилитации наркологических больных (алкоголизм, наркомании, токсикомании)». Программа находится в русле гуманистических традиций отечественного здравоохранения, согласно которым реабилитационной работе придается большое значение в процессе восстановления пациентов. При составлении программы использованы теоретические и научно-практические разработки ведущих сотрудников НИИ наркологии, а также материалы анализа мирового опыта создания и внедрения реабилитационных программ. Кроме того, применялись методы системного, структурного анализа, процессный подход к рассмотрению организации.
Описание процесса реабилитации является необходимым условием для понимания сущности деятельности Центра, построения структуры управления данным процессом. Пациент, поступающий в учреждение, проходит за время своего пребывания несколько этапов, меняющих его отношение к употреблению наркотиков и взаимоотношению с обществом. Процесс реабилитации заключается в активной последовательной позитивной реорганизации жизненной ситуации пациента во всех ее личных и социальных аспектах с учетом реально достижимых конкретных результатов.
Этапы процесса реабилитации – это обособленные по функциональному и временному признаку, по применяемым методам и средствам группы работ, являющиеся необходимым условием протекания процесса. В этой связи принципы последовательности, этапности и комплексности лечебно-реабилитационного процесса предполагают переход от медико-психологических к психо-социальным мероприятиям.

1 этап – Адаптационный (1-3 месяца)
2 этап – Интеграционный (3 месяца)
3 этап – Стабилизационный (3 месяца)

Эффективность медико – социальной реабилитационной программы в среднем превышает зарубежные стандарты.